/BCO-DMO/OA_coral_physiology/coral_calc_and_energy ---- Level 1
# Coral Calcification and Energy Reserves
# Data published in Schoepf et al. 2013 PLoSONE (doi: 10.1371/journal.pone.0075049)
# PI: Andrea Grottoli (The Ohio State University)
# Co-PIs: Mark Warner & Wei-Jun Cai (University of Delaware)
# Version history:
# version 3 (current): 23 September 2015 (replaced entire dataset w/ new/corrected version subm)
# version 2: 15)
# version 2: 31 July 2015 (values changed from displaying 2 decimal places to 4 decimal places)September 2014 8 September 2014 (original)
=========================
species
-------------------------
Acropora_millepora
=========================
coral_ID temp pCO2 genotype calcification_1st_half calcification_2nd_half chlorophyll_a cell_density lipid protein carbs tissue_biomass
-------------------------
AMNBLC1 26.5 382 1 0.0675 0.0694 2.0455 0.2000 0.1061 0.0764 0.0192 7.0108
AMNBLC2 26.5 382 2 0.0106 0.0831 2.2750 0.1668 0.1444 0.0612 0.0165 7.2130
AMNBLC3 26.5 382 3 0.1571 0.1560 5.4939 0.4744 0.1121 0.0545 0.0135 5.0362
AMNBLC4 26.5 382 4 0.0436 0.0375 1.5550 0.1434 0.0833 0.0524 0.0156 8.4706
AMNBLC5 26.5 382 5 0.0534 0.0689 13.3576 1.3846 0.1449 0.0769 0.0284 8.1625
AMNBLC6 26.5 382 6 0.0545 0.0435 1.6675 0.1414 0.1546 0.0372 0.0116 6.7815
AMBLLC1 29.0 382 1 0.0563 0.0436 1.5333 0.1351 0.0645 0.0737 0.0177 7.1440
AMBLLC2 29.0 382 2 0.0654 0.0813 1.7748 0.1498 0.1145 0.0944 0.0168 7.4260
AMBLLC3 29.0 382 3 0.0777 0.0718 1.7980 0.2168 0.1067 0.0933 0.0123 6.2845
AMBLLC4 29.0 382 4 0.0783 0.0758 2.1000 0.2279 0.1250 0.0989 0.0163 7.6530
AMBLLC5 29.0 382 5 0.0611 0.0617 1.6646 0.2599 0.1206 0.0692 0.0129 9.4475
AMBLLC6 29.0 382 6 0.0325 0.0201 1.4253 0.1197 0.1195 0.0909 0.0162 7.2600
AMNBMC1 26.5 607 1 0.0341 0.0492 0.8295 0.1362 0.1513 0.0885 0.0166 8.6585
AMNBMC2 26.5 607 2 0.0672 0.0619 1.8317 0.2139 0.1603 0.0999 0.0166 7.3508
AMNBMC3 26.5 607 3 0.0670 0.0860 1.4255 0.2327 0.1553 0.0791 0.0122 9.5347
AMNBMC4 26.5 607 4 0.0467 0.0467 0.8407 0.1550 0.1316 0.0649 0.0118 7.9746
AMNBMC5 26.5 607 5 0.0671 0.0555 1.0904 0.2059 0.1503 0.0583 0.0135 7.5501
AMNBMC6 26.5 607 6 0.0329 0.0270 1.1463 0.1655 0.1513 0.0910 0.0173 5.7881
AMBLMC1 29.0 607 1 0.0581 0.0680 1.3247 0.2056 0.1200 0.0487 0.0074 7.5058
AMBLMC2 29.0 607 2 0.0609 0.0274 0.8009 0.1204 0.1678 0.0651 0.0130 7.0604
AMBLMC3 29.0 607 3 0.0635 0.2884 1.1199 0.1583 0.1407 0.0489 0.0080 9.2910
AMBLMC4 29.0 607 4 0.0584 0.0556 0.8929 0.1334 0.1646 0.0989 0.0173 11.0761
AMBLMC5 29.0 607 5 0.0445 0.0680 0.6452 0.1128 0.1338 0.0553 0.0095 6.8492
AMBLMC6 29.0 607 6 0.0249 0.0201 0.4392 0.0837 0.1583 0.0734 0.0124 8.5976
AMNBHC1 26.5 741 1 0.0408 0.0328 1.2543 0.1698 0.1485 0.1043 0.0187 10.5022
AMNBHC2 26.5 741 2 0.1038 0.0477 2.4431 0.3648 0.1765 0.0960 0.0182 9.7194
AMNBHC3 26.5 741 3 0.0692 0.0352 1.5952 0.1970 0.1299 0.0955 0.0159 9.4920
AMNBHC4 26.5 741 4 0.1008 0.0577 3.5664 0.3914 0.1484 0.0880 0.0194 9.1072
AMNBHC5 26.5 741 5 0.0539 0.0130 1.5757 0.2179 0.1264 0.1333 0.0295 8.1585
AMNBHC6 26.5 741 6 0.0463 0.0014 3.1753 0.4631 0.2150 0.1012 0.0202 7.7322
AMBLHC1 29.0 741 1 0.0309 0.0173 2.4688 0.2763 0.0870 0.0872 0.0151 6.9010
AMBLHC2 29.0 741 2 0.0665 0.0447 1.6831 0.1927 0.1525 0.1219 0.0218 10.4017
AMBLHC3 29.0 741 3 0.0483 0.0577 1.2337 0.1745 0.0633 0.0616 0.0099 9.5106
AMBLHC4 29.0 741 4 0.0237 -0.4559 1.1308 0.1425 0.0833 0.0900 0.0200 7.2306
AMBLHC5 29.0 741 5 0.0245 0.0258 1.3571 0.1562 0.1923 0.1008 0.0167 6.4379
AMBLHC6 29.0 741 6 0.0427 0.0160 3.3239 0.3659 0.1654 0.0803 0.0156 9.2383
=========================
species
-------------------------
Pocillopora_damicornis
=========================
coral_ID temp pCO2 genotype calcification_1st_half calcification_2nd_half chlorophyll_a cell_density lipid protein carbs tissue_biomass
-------------------------
PDNBLC1 26.5 382 1 0.0151 0.0457 2.1754 0.3046 0.1341 0.1388 0.0121 4.2403
PDNBLC2 26.5 382 2 0.0234 0.0545 2.6469 0.2700 0.1544 0.1507 0.0145 4.3278
PDNBLC3 26.5 382 3 0.0139 0.0784 2.8012 0.3331 0.1392 0.0991 0.0107 7.6479
PDNBLC4 26.5 382 4 0.1291 0.0883 2.6676 0.2865 0.1105 0.1086 0.0109 5.6667
PDNBLC5 26.5 382 5 0.0524 0.0951 3.0828 0.2827 0.1290 0.1332 0.0125 5.3369
PDNBLC6 26.5 382 6 0.0872 0.0872 2.2049 0.2063 0.0887 0.0982 0.0101 6.7212
PDBLLC1 29.0 382 1 0.0556 0.1960 2.9697 0.2096 0.1618 0.1327 0.0119 4.9481
PDBLLC2 29.0 382 2 0.0549 0.1809 2.9729 0.2671 0.1731 0.1065 0.0156 5.3289
PDBLLC3 29.0 382 3 0.0595 0.0947 3.5399 0.3672 0.0624 0.1053 0.0116 6.0606
PDBLLC4 29.0 382 4 0.2492 0.1917 3.4709 0.3595 0.0944 0.1073 0.0097 7.5389
PDBLLC5 29.0 382 5 0.0675 0.1059 3.2954 0.2294 0.1102 0.1337 0.0107 4.9674
PDBLLC6 29.0 382 6 0.0961 0.0865 2.3576 0.2334 0.0682 0.1407 0.0098 4.3215
PDNBMC1 26.5 607 1 0.0470 0.1395 1.1515 0.1645 0.1594 0.1057 0.0095 6.6176
PDNBMC2 26.5 607 2 0.0389 0.1480 1.8105 0.2331 0.2091 0.1081 0.0103 6.7340
PDNBMC3 26.5 607 3 0.0378 0.0849 1.1371 0.1548 0.1917 0.1488 0.0144 6.2048
PDNBMC4 26.5 607 4 0.1379 0.2427 2.6303 0.3932 0.2624 0.1131 0.0130 5.7573
PDNBMC5 26.5 607 5 0.0657 0.1382 2.0292 0.2310 0.1700 0.1620 0.0164 9.3607
PDNBMC6 26.5 607 6 0.1131 0.1979 2.4376 0.2448 0.0928 0.1140 0.0099 5.5698
PDBLMC1 29.0 607 1 0.0137 0.0453 1.4077 0.1769 0.2762 0.1186 0.0104 5.5944
PDBLMC2 29.0 607 2 -0.0108 0.1839 1.5624 0.1380 0.2185 0.1261 0.0122 5.7673
PDBLMC3 29.0 607 3 0.0179 0.1371 1.6098 0.1724 0.1358 0.1406 0.0147 4.6975
PDBLMC4 29.0 607 4 0.1321 0.2132 1.4573 0.1152 0.1130 0.1324 0.0153 6.7395
PDBLMC5 29.0 607 5 0.0413 0.1301 2.6557 0.1895 0.1287 0.1499 0.0150 5.8411
PDBLMC6 29.0 607 6 0.0900 0.1479 1.2936 0.1204 0.0595 0.1524 0.0115 4.9770
PDNBHC1 26.5 741 1 0.0474 0.0630 1.5550 0.1042 0.1946 0.1153 0.0114 5.8824
PDNBHC2 26.5 741 2 0.0770 0.2046 1.9431 0.2134 0.1232 0.1455 0.0152 4.7133
PDNBHC3 26.5 741 3 0.0430 0.0010 1.6738 0.1670 0.1549 0.1457 0.0120 4.9319
PDNBHC4 26.5 741 4 0.2076 0.1832 2.1499 0.2655 0.1221 0.1185 0.0120 6.1688
PDNBHC5 26.5 741 5 0.0881 0.1047 2.2842 0.2103 0.1000 0.0880 0.0102 7.2633
PDNBHC6 26.5 741 6 0.1233 0.1032 2.4884 0.2480 0.0993 0.1619 0.0199 5.8644
PDBLHC1 29.0 741 1 0.0477 0.9940 3.1188 0.2599 0.1871 0.1355 0.0157 4.7751
PDBLHC2 29.0 741 2 0.0358 0.1597 3.3229 0.2191 0.1752 0.1023 0.0119 5.2989
PDBLHC3 29.0 741 3 0.0539 0.1411 2.5860 0.2099 0.1645 0.1099 0.0116 5.2034
PDBLHC4 29.0 741 4 0.1465 0.1966 3.5581 0.2371 0.1148 0.1387 0.0112 7.2041
PDBLHC5 29.0 741 5 0.0604 0.0876 3.7737 0.2778 0.1712 0.1580 0.0137 5.5500
PDBLHC6 29.0 741 6 0.1070 0.1672 3.8268 0.3294 0.0763 0.1290 0.0130 7.2695
=========================
species
-------------------------
Montipora_monasteriata
=========================
coral_ID temp pCO2 genotype calcification_1st_half calcification_2nd_half chlorophyll_a cell_density lipid protein carbs tissue_biomass
-------------------------
MMNBLC1 26.5 382 1 0.3949 0.3808 5.1315 1.0115 0.1200 0.0812 0.0202 6.5396
MMNBLC2 26.5 382 2 0.3872 0.3972 6.1851 0.9229 0.1043 0.0651 0.0181 nd
MMNBLC3 26.5 382 3 0.1427 0.1088 8.7687 1.1266 0.1556 0.1022 0.0234 7.1259
MMNBLC4 26.5 382 4 0.2965 0.4603 8.1489 1.5885 0.1276 0.0856 0.0265 7.9771
MMNBLC5 26.5 382 5 0.3711 0.2614 8.6642 1.0796 0.0821 0.0593 0.0194 5.1037
MMNBLC6 26.5 382 6 0.4448 0.5859 7.4972 1.2389 0.1126 0.1218 0.0354 11.2206
MMBLLC1 29.0 382 1 0.3984 0.3020 4.7910 0.7667 0.1053 0.0286 0.0169 6.9225
MMBLLC2 29.0 382 2 0.4272 0.1517 4.3133 0.8371 0.1111 0.0478 0.0311 4.7643
MMBLLC3 29.0 382 3 0.4103 0.3155 3.1936 0.6279 0.0984 0.0637 0.0298 3.9789
MMBLLC4 29.0 382 4 0.6487 0.5004 3.6491 0.5567 0.1158 0.0712 0.0323 9.2628
MMBLLC5 29.0 382 5 0.3397 0.2232 3.2755 0.7380 0.0992 0.0539 0.0226 nd
MMBLLC6 29.0 382 6 0.4850 0.5828 5.3125 0.7922 0.1259 0.1091 0.0281 7.8641
MMNBMC1 26.5 607 1 0.2832 0.1956 3.5430 0.5711 0.1081 0.0269 0.0120 7.1656
MMNBMC2 26.5 607 2 0.3198 0.2471 4.8068 0.8516 0.0952 0.0506 0.0198 5.1802
MMNBMC3 26.5 607 3 0.2156 0.1595 4.5449 0.9527 0.1226 0.0600 0.0196 5.8701
MMNBMC4 26.5 607 4 0.3390 0.4386 4.3961 0.8500 0.1160 0.0602 0.0277 5.9531
MMNBMC5 26.5 607 5 0.1567 0.2309 4.7224 0.8349 0.1574 0.0406 0.0240 5.0189
MMNBMC6 26.5 607 6 0.5452 0.5746 4.2433 0.8045 0.1667 0.0933 0.0297 7.4330
MMBLMC1 29.0 607 1 0.3673 0.2335 4.5067 0.6768 0.1330 0.0677 0.0192 8.6605
MMBLMC2 29.0 607 2 0.3642 0.2494 3.0985 0.4638 0.1330 0.0857 0.0241 5.2736
MMBLMC3 29.0 607 3 0.3747 0.3593 5.3315 0.7280 0.1379 0.0775 0.0270 4.8814
MMBLMC4 29.0 607 4 0.4489 0.4667 2.8896 0.2906 0.1007 0.0806 0.0222 5.8201
MMBLMC5 29.0 607 5 0.3264 0.2632 3.5772 0.4767 0.1181 0.0442 0.0182 4.4752
MMBLMC6 29.0 607 6 0.5797 0.6763 4.5466 0.8290 0.1306 0.0957 0.0326 10.0697
MMNBHC1 26.5 741 1 0.3502 0.2245 8.8428 1.2204 0.1182 0.0631 0.0168 5.3964
MMNBHC2 26.5 741 2 0.3994 0.4301 4.1648 0.6998 0.1314 0.0524 0.0189 7.9943
MMNBHC3 26.5 741 3 0.2929 0.2053 6.8023 1.4455 0.1111 0.0454 0.0178 8.1489
MMNBHC4 26.5 741 4 0.5031 0.2988 6.0994 0.8647 0.1172 0.0587 0.0229 7.3073
MMNBHC5 26.5 741 5 0.3411 0.2598 5.2001 0.9165 0.1250 0.0412 0.0232 6.6462
MMNBHC6 26.5 741 6 0.6118 0.3326 8.0811 1.2713 0.1401 0.0729 0.0290 6.7189
MMBLHC1 29.0 741 1 0.4180 0.1440 3.7377 0.6241 0.0980 0.1075 0.0267 8.4250
MMBLHC2 29.0 741 2 0.3222 0.2013 4.6502 0.7779 0.1111 0.0945 0.0238 9.1958
MMBLHC3 29.0 741 3 0.3914 0.0998 4.5300 0.8214 0.1441 0.0802 0.0280 7.5313
MMBLHC4 29.0 741 4 0.5071 0.5423 5.1268 0.7432 0.1174 0.0811 0.0258 nd
MMBLHC5 29.0 741 5 0.4014 0.2663 3.5358 0.7055 0.1235 0.0680 0.0284 5.7467
MMBLHC6 29.0 741 6 0.3031 0.3472 5.9818 0.8911 0.1086 0.1012 0.0277 nd
=========================
species
-------------------------
Turbinaria_reniformis
=========================
coral_ID temp pCO2 genotype calcification_1st_half calcification_2nd_half chlorophyll_a cell_density lipid protein carbs tissue_biomass
-------------------------
TRNBLC1 26.5 382 1 0.2039 0.2313 4.4044 0.7293 0.0989 0.1460 0.0198 12.6653
TRNBLC2 26.5 382 2 0.2946 0.2609 3.6880 0.6445 0.1023 0.1276 0.0146 10.1004
TRNBLC3 26.5 382 3 0.1983 0.2211 3.6594 0.7692 0.1053 0.1623 0.0290 14.9696
TRNBLC4 26.5 382 4 0.3287 0.3292 4.8574 0.5423 0.1194 0.1438 0.0239 13.5438
TRNBLC5 26.5 382 5 0.2542 0.2721 2.1266 0.6072 0.1094 0.1391 0.0242 11.8293
TRNBLC6 26.5 382 6 0.1821 0.1386 0.9240 0.1871 0.1131 0.1247 0.0296 10.4901
TRBLLC1 29.0 382 1 0.3767 0.2511 4.4633 0.6055 0.0979 0.1472 0.0245 9.2501
TRBLLC2 29.0 382 2 0.2577 0.2577 5.2033 0.7539 0.1548 0.1300 0.0260 7.6332
TRBLLC3 29.0 382 3 0.3963 0.3049 4.2684 0.6214 0.1319 0.1628 0.0294 11.6901
TRBLLC4 29.0 382 4 0.2659 -0.0441 6.2187 1.3215 0.0748 0.0990 0.0127 8.5805
TRBLLC5 29.0 382 5 0.3542 0.2827 5.2673 0.8818 0.0603 0.1289 0.0291 11.1460
TRBLLC6 29.0 382 6 0.1090 0.1122 2.3970 0.3777 0.1186 0.0102 0.0022 9.8907
TRNBMC1 26.5 607 1 0.2853 -0.5289 2.5664 0.6633 0.1148 0.0903 0.0113 8.5938
TRNBMC2 26.5 607 2 0.2338 0.3269 2.1566 0.4465 0.1281 0.0984 0.0186 11.9185
TRNBMC3 26.5 607 3 0.1074 0.1771 2.3575 0.4677 0.0935 0.1311 0.0273 12.8183
TRNBMC4 26.5 607 4 0.2316 0.2968 0.7547 0.2805 0.1538 0.1062 0.0183 10.6208
TRNBMC5 26.5 607 5 0.3615 0.4189 1.5672 0.5083 0.0947 0.1232 0.0219 9.2000
TRNBMC6 26.5 607 6 0.0703 0.0978 1.2278 0.3048 0.1084 0.0797 0.0176 12.9324
TRBLMC1 29.0 607 1 0.2748 0.2698 1.7796 0.3465 0.0984 0.1380 0.0231 12.7971
TRBLMC2 29.0 607 2 0.2423 0.1607 1.6907 0.3312 0.1027 0.1589 0.0256 14.5675
TRBLMC3 29.0 607 3 0.3275 0.3882 6.7408 1.0325 0.1017 0.0840 0.0153 16.1401
TRBLMC4 29.0 607 4 0.3025 0.2974 3.2236 0.6001 0.1203 0.1373 0.0252 9.8677
TRBLMC5 29.0 607 5 0.2633 0.3076 3.0542 0.6177 0.0936 0.1270 0.0243 10.7532
TRBLMC6 29.0 607 6 0.0660 0.1175 2.3352 0.4881 0.1148 0.0834 0.0165 7.9507
TRNBHC1 26.5 741 1 0.1902 0.2161 4.3232 0.7495 0.0973 0.1024 0.0163 9.3993
TRNBHC2 26.5 741 2 0.3091 0.2705 4.4100 1.0529 0.1143 0.1026 0.0143 9.4072
TRNBHC3 26.5 741 3 0.3789 0.2747 4.6777 0.9529 0.0940 0.1209 0.0164 12.0778
TRNBHC4 26.5 741 4 0.2862 0.2078 2.0351 0.3317 0.1152 0.1210 0.0220 15.5896
TRNBHC5 26.5 741 5 0.3400 0.2443 3.0033 0.7638 0.0812 0.1625 0.0289 8.7500
TRNBHC6 26.5 741 6 0.0917 0.0607 2.7895 0.5645 0.1284 0.0930 0.0177 6.9183
TRBLHC1 29.0 741 1 0.2564 0.0787 5.6508 0.6000 0.0810 0.1431 0.0210 11.4948
TRBLHC2 29.0 741 2 0.2208 0.1560 3.1666 0.5059 0.1042 0.1697 0.0303 12.3266
TRBLHC3 29.0 741 3 0.3386 0.2642 1.7518 0.2989 0.1040 0.1322 0.0252 15.0079
TRBLHC4 29.0 741 4 0.2125 0.1649 2.9042 0.4018 0.0930 0.1266 0.0222 10.9300
TRBLHC5 29.0 741 5 0.2713 0.1817 2.2299 0.3474 0.1241 0.1293 0.0274 8.3818
TRBLHC6 29.0 741 6 0.1066 0.0714 1.7178 0.2624 0.0940 0.1371 0.0328 7.2824