/BCO-DMO/OA_coral_physiology/coral_calc_and_energy ---- Level 1

      Directory  DocumentationDownload and Other Operations...

        Level 0 - At last level -       Flat list

# Coral Calcification and Energy Reserves
#  Data published in Schoepf et al. 2013 PLoSONE (doi: 10.1371/journal.pone.0075049)
# PI: Andrea Grottoli (The Ohio State University)
# Co-PIs: Mark Warner & Wei-Jun Cai (University of Delaware)
# Version history:
#  version 3 (current):  23 September 2015 (replaced entire dataset w/ new/corrected version subm)
#  version 2:  15)
#  version 2:  31 July 2015 (values changed from displaying 2 decimal places to 4 decimal places)September 2014 8 September 2014 (original)
=========================
species                    
-------------------------
Acropora_millepora         
=========================
coral_ID  temp   pCO2   genotype  calcification_1st_half  calcification_2nd_half  chlorophyll_a  cell_density  lipid    protein  carbs    tissue_biomass  
-------------------------
AMNBLC1   26.5   382    1         0.0675                  0.0694                  2.0455         0.2000        0.1061   0.0764   0.0192   7.0108          
AMNBLC2   26.5   382    2         0.0106                  0.0831                  2.2750         0.1668        0.1444   0.0612   0.0165   7.2130          
AMNBLC3   26.5   382    3         0.1571                  0.1560                  5.4939         0.4744        0.1121   0.0545   0.0135   5.0362          
AMNBLC4   26.5   382    4         0.0436                  0.0375                  1.5550         0.1434        0.0833   0.0524   0.0156   8.4706          
AMNBLC5   26.5   382    5         0.0534                  0.0689                  13.3576        1.3846        0.1449   0.0769   0.0284   8.1625          
AMNBLC6   26.5   382    6         0.0545                  0.0435                  1.6675         0.1414        0.1546   0.0372   0.0116   6.7815          
AMBLLC1   29.0   382    1         0.0563                  0.0436                  1.5333         0.1351        0.0645   0.0737   0.0177   7.1440          
AMBLLC2   29.0   382    2         0.0654                  0.0813                  1.7748         0.1498        0.1145   0.0944   0.0168   7.4260          
AMBLLC3   29.0   382    3         0.0777                  0.0718                  1.7980         0.2168        0.1067   0.0933   0.0123   6.2845          
AMBLLC4   29.0   382    4         0.0783                  0.0758                  2.1000         0.2279        0.1250   0.0989   0.0163   7.6530          
AMBLLC5   29.0   382    5         0.0611                  0.0617                  1.6646         0.2599        0.1206   0.0692   0.0129   9.4475          
AMBLLC6   29.0   382    6         0.0325                  0.0201                  1.4253         0.1197        0.1195   0.0909   0.0162   7.2600          
AMNBMC1   26.5   607    1         0.0341                  0.0492                  0.8295         0.1362        0.1513   0.0885   0.0166   8.6585          
AMNBMC2   26.5   607    2         0.0672                  0.0619                  1.8317         0.2139        0.1603   0.0999   0.0166   7.3508          
AMNBMC3   26.5   607    3         0.0670                  0.0860                  1.4255         0.2327        0.1553   0.0791   0.0122   9.5347          
AMNBMC4   26.5   607    4         0.0467                  0.0467                  0.8407         0.1550        0.1316   0.0649   0.0118   7.9746          
AMNBMC5   26.5   607    5         0.0671                  0.0555                  1.0904         0.2059        0.1503   0.0583   0.0135   7.5501          
AMNBMC6   26.5   607    6         0.0329                  0.0270                  1.1463         0.1655        0.1513   0.0910   0.0173   5.7881          
AMBLMC1   29.0   607    1         0.0581                  0.0680                  1.3247         0.2056        0.1200   0.0487   0.0074   7.5058          
AMBLMC2   29.0   607    2         0.0609                  0.0274                  0.8009         0.1204        0.1678   0.0651   0.0130   7.0604          
AMBLMC3   29.0   607    3         0.0635                  0.2884                  1.1199         0.1583        0.1407   0.0489   0.0080   9.2910          
AMBLMC4   29.0   607    4         0.0584                  0.0556                  0.8929         0.1334        0.1646   0.0989   0.0173   11.0761         
AMBLMC5   29.0   607    5         0.0445                  0.0680                  0.6452         0.1128        0.1338   0.0553   0.0095   6.8492          
AMBLMC6   29.0   607    6         0.0249                  0.0201                  0.4392         0.0837        0.1583   0.0734   0.0124   8.5976          
AMNBHC1   26.5   741    1         0.0408                  0.0328                  1.2543         0.1698        0.1485   0.1043   0.0187   10.5022         
AMNBHC2   26.5   741    2         0.1038                  0.0477                  2.4431         0.3648        0.1765   0.0960   0.0182   9.7194          
AMNBHC3   26.5   741    3         0.0692                  0.0352                  1.5952         0.1970        0.1299   0.0955   0.0159   9.4920          
AMNBHC4   26.5   741    4         0.1008                  0.0577                  3.5664         0.3914        0.1484   0.0880   0.0194   9.1072          
AMNBHC5   26.5   741    5         0.0539                  0.0130                  1.5757         0.2179        0.1264   0.1333   0.0295   8.1585          
AMNBHC6   26.5   741    6         0.0463                  0.0014                  3.1753         0.4631        0.2150   0.1012   0.0202   7.7322          
AMBLHC1   29.0   741    1         0.0309                  0.0173                  2.4688         0.2763        0.0870   0.0872   0.0151   6.9010          
AMBLHC2   29.0   741    2         0.0665                  0.0447                  1.6831         0.1927        0.1525   0.1219   0.0218   10.4017         
AMBLHC3   29.0   741    3         0.0483                  0.0577                  1.2337         0.1745        0.0633   0.0616   0.0099   9.5106          
AMBLHC4   29.0   741    4         0.0237                  -0.4559                 1.1308         0.1425        0.0833   0.0900   0.0200   7.2306          
AMBLHC5   29.0   741    5         0.0245                  0.0258                  1.3571         0.1562        0.1923   0.1008   0.0167   6.4379          
AMBLHC6   29.0   741    6         0.0427                  0.0160                  3.3239         0.3659        0.1654   0.0803   0.0156   9.2383          
=========================
species                    
-------------------------
Pocillopora_damicornis     
=========================
coral_ID  temp   pCO2   genotype  calcification_1st_half  calcification_2nd_half  chlorophyll_a  cell_density  lipid    protein  carbs    tissue_biomass  
-------------------------
PDNBLC1   26.5   382    1         0.0151                  0.0457                  2.1754         0.3046        0.1341   0.1388   0.0121   4.2403          
PDNBLC2   26.5   382    2         0.0234                  0.0545                  2.6469         0.2700        0.1544   0.1507   0.0145   4.3278          
PDNBLC3   26.5   382    3         0.0139                  0.0784                  2.8012         0.3331        0.1392   0.0991   0.0107   7.6479          
PDNBLC4   26.5   382    4         0.1291                  0.0883                  2.6676         0.2865        0.1105   0.1086   0.0109   5.6667          
PDNBLC5   26.5   382    5         0.0524                  0.0951                  3.0828         0.2827        0.1290   0.1332   0.0125   5.3369          
PDNBLC6   26.5   382    6         0.0872                  0.0872                  2.2049         0.2063        0.0887   0.0982   0.0101   6.7212          
PDBLLC1   29.0   382    1         0.0556                  0.1960                  2.9697         0.2096        0.1618   0.1327   0.0119   4.9481          
PDBLLC2   29.0   382    2         0.0549                  0.1809                  2.9729         0.2671        0.1731   0.1065   0.0156   5.3289          
PDBLLC3   29.0   382    3         0.0595                  0.0947                  3.5399         0.3672        0.0624   0.1053   0.0116   6.0606          
PDBLLC4   29.0   382    4         0.2492                  0.1917                  3.4709         0.3595        0.0944   0.1073   0.0097   7.5389          
PDBLLC5   29.0   382    5         0.0675                  0.1059                  3.2954         0.2294        0.1102   0.1337   0.0107   4.9674          
PDBLLC6   29.0   382    6         0.0961                  0.0865                  2.3576         0.2334        0.0682   0.1407   0.0098   4.3215          
PDNBMC1   26.5   607    1         0.0470                  0.1395                  1.1515         0.1645        0.1594   0.1057   0.0095   6.6176          
PDNBMC2   26.5   607    2         0.0389                  0.1480                  1.8105         0.2331        0.2091   0.1081   0.0103   6.7340          
PDNBMC3   26.5   607    3         0.0378                  0.0849                  1.1371         0.1548        0.1917   0.1488   0.0144   6.2048          
PDNBMC4   26.5   607    4         0.1379                  0.2427                  2.6303         0.3932        0.2624   0.1131   0.0130   5.7573          
PDNBMC5   26.5   607    5         0.0657                  0.1382                  2.0292         0.2310        0.1700   0.1620   0.0164   9.3607          
PDNBMC6   26.5   607    6         0.1131                  0.1979                  2.4376         0.2448        0.0928   0.1140   0.0099   5.5698          
PDBLMC1   29.0   607    1         0.0137                  0.0453                  1.4077         0.1769        0.2762   0.1186   0.0104   5.5944          
PDBLMC2   29.0   607    2         -0.0108                 0.1839                  1.5624         0.1380        0.2185   0.1261   0.0122   5.7673          
PDBLMC3   29.0   607    3         0.0179                  0.1371                  1.6098         0.1724        0.1358   0.1406   0.0147   4.6975          
PDBLMC4   29.0   607    4         0.1321                  0.2132                  1.4573         0.1152        0.1130   0.1324   0.0153   6.7395          
PDBLMC5   29.0   607    5         0.0413                  0.1301                  2.6557         0.1895        0.1287   0.1499   0.0150   5.8411          
PDBLMC6   29.0   607    6         0.0900                  0.1479                  1.2936         0.1204        0.0595   0.1524   0.0115   4.9770          
PDNBHC1   26.5   741    1         0.0474                  0.0630                  1.5550         0.1042        0.1946   0.1153   0.0114   5.8824          
PDNBHC2   26.5   741    2         0.0770                  0.2046                  1.9431         0.2134        0.1232   0.1455   0.0152   4.7133          
PDNBHC3   26.5   741    3         0.0430                  0.0010                  1.6738         0.1670        0.1549   0.1457   0.0120   4.9319          
PDNBHC4   26.5   741    4         0.2076                  0.1832                  2.1499         0.2655        0.1221   0.1185   0.0120   6.1688          
PDNBHC5   26.5   741    5         0.0881                  0.1047                  2.2842         0.2103        0.1000   0.0880   0.0102   7.2633          
PDNBHC6   26.5   741    6         0.1233                  0.1032                  2.4884         0.2480        0.0993   0.1619   0.0199   5.8644          
PDBLHC1   29.0   741    1         0.0477                  0.9940                  3.1188         0.2599        0.1871   0.1355   0.0157   4.7751          
PDBLHC2   29.0   741    2         0.0358                  0.1597                  3.3229         0.2191        0.1752   0.1023   0.0119   5.2989          
PDBLHC3   29.0   741    3         0.0539                  0.1411                  2.5860         0.2099        0.1645   0.1099   0.0116   5.2034          
PDBLHC4   29.0   741    4         0.1465                  0.1966                  3.5581         0.2371        0.1148   0.1387   0.0112   7.2041          
PDBLHC5   29.0   741    5         0.0604                  0.0876                  3.7737         0.2778        0.1712   0.1580   0.0137   5.5500          
PDBLHC6   29.0   741    6         0.1070                  0.1672                  3.8268         0.3294        0.0763   0.1290   0.0130   7.2695          
=========================
species                    
-------------------------
Montipora_monasteriata     
=========================
coral_ID  temp   pCO2   genotype  calcification_1st_half  calcification_2nd_half  chlorophyll_a  cell_density  lipid    protein  carbs    tissue_biomass  
-------------------------
MMNBLC1   26.5   382    1         0.3949                  0.3808                  5.1315         1.0115        0.1200   0.0812   0.0202   6.5396          
MMNBLC2   26.5   382    2         0.3872                  0.3972                  6.1851         0.9229        0.1043   0.0651   0.0181   nd              
MMNBLC3   26.5   382    3         0.1427                  0.1088                  8.7687         1.1266        0.1556   0.1022   0.0234   7.1259          
MMNBLC4   26.5   382    4         0.2965                  0.4603                  8.1489         1.5885        0.1276   0.0856   0.0265   7.9771          
MMNBLC5   26.5   382    5         0.3711                  0.2614                  8.6642         1.0796        0.0821   0.0593   0.0194   5.1037          
MMNBLC6   26.5   382    6         0.4448                  0.5859                  7.4972         1.2389        0.1126   0.1218   0.0354   11.2206         
MMBLLC1   29.0   382    1         0.3984                  0.3020                  4.7910         0.7667        0.1053   0.0286   0.0169   6.9225          
MMBLLC2   29.0   382    2         0.4272                  0.1517                  4.3133         0.8371        0.1111   0.0478   0.0311   4.7643          
MMBLLC3   29.0   382    3         0.4103                  0.3155                  3.1936         0.6279        0.0984   0.0637   0.0298   3.9789          
MMBLLC4   29.0   382    4         0.6487                  0.5004                  3.6491         0.5567        0.1158   0.0712   0.0323   9.2628          
MMBLLC5   29.0   382    5         0.3397                  0.2232                  3.2755         0.7380        0.0992   0.0539   0.0226   nd              
MMBLLC6   29.0   382    6         0.4850                  0.5828                  5.3125         0.7922        0.1259   0.1091   0.0281   7.8641          
MMNBMC1   26.5   607    1         0.2832                  0.1956                  3.5430         0.5711        0.1081   0.0269   0.0120   7.1656          
MMNBMC2   26.5   607    2         0.3198                  0.2471                  4.8068         0.8516        0.0952   0.0506   0.0198   5.1802          
MMNBMC3   26.5   607    3         0.2156                  0.1595                  4.5449         0.9527        0.1226   0.0600   0.0196   5.8701          
MMNBMC4   26.5   607    4         0.3390                  0.4386                  4.3961         0.8500        0.1160   0.0602   0.0277   5.9531          
MMNBMC5   26.5   607    5         0.1567                  0.2309                  4.7224         0.8349        0.1574   0.0406   0.0240   5.0189          
MMNBMC6   26.5   607    6         0.5452                  0.5746                  4.2433         0.8045        0.1667   0.0933   0.0297   7.4330          
MMBLMC1   29.0   607    1         0.3673                  0.2335                  4.5067         0.6768        0.1330   0.0677   0.0192   8.6605          
MMBLMC2   29.0   607    2         0.3642                  0.2494                  3.0985         0.4638        0.1330   0.0857   0.0241   5.2736          
MMBLMC3   29.0   607    3         0.3747                  0.3593                  5.3315         0.7280        0.1379   0.0775   0.0270   4.8814          
MMBLMC4   29.0   607    4         0.4489                  0.4667                  2.8896         0.2906        0.1007   0.0806   0.0222   5.8201          
MMBLMC5   29.0   607    5         0.3264                  0.2632                  3.5772         0.4767        0.1181   0.0442   0.0182   4.4752          
MMBLMC6   29.0   607    6         0.5797                  0.6763                  4.5466         0.8290        0.1306   0.0957   0.0326   10.0697         
MMNBHC1   26.5   741    1         0.3502                  0.2245                  8.8428         1.2204        0.1182   0.0631   0.0168   5.3964          
MMNBHC2   26.5   741    2         0.3994                  0.4301                  4.1648         0.6998        0.1314   0.0524   0.0189   7.9943          
MMNBHC3   26.5   741    3         0.2929                  0.2053                  6.8023         1.4455        0.1111   0.0454   0.0178   8.1489          
MMNBHC4   26.5   741    4         0.5031                  0.2988                  6.0994         0.8647        0.1172   0.0587   0.0229   7.3073          
MMNBHC5   26.5   741    5         0.3411                  0.2598                  5.2001         0.9165        0.1250   0.0412   0.0232   6.6462          
MMNBHC6   26.5   741    6         0.6118                  0.3326                  8.0811         1.2713        0.1401   0.0729   0.0290   6.7189          
MMBLHC1   29.0   741    1         0.4180                  0.1440                  3.7377         0.6241        0.0980   0.1075   0.0267   8.4250          
MMBLHC2   29.0   741    2         0.3222                  0.2013                  4.6502         0.7779        0.1111   0.0945   0.0238   9.1958          
MMBLHC3   29.0   741    3         0.3914                  0.0998                  4.5300         0.8214        0.1441   0.0802   0.0280   7.5313          
MMBLHC4   29.0   741    4         0.5071                  0.5423                  5.1268         0.7432        0.1174   0.0811   0.0258   nd              
MMBLHC5   29.0   741    5         0.4014                  0.2663                  3.5358         0.7055        0.1235   0.0680   0.0284   5.7467          
MMBLHC6   29.0   741    6         0.3031                  0.3472                  5.9818         0.8911        0.1086   0.1012   0.0277   nd              
=========================
species                    
-------------------------
Turbinaria_reniformis      
=========================
coral_ID  temp   pCO2   genotype  calcification_1st_half  calcification_2nd_half  chlorophyll_a  cell_density  lipid    protein  carbs    tissue_biomass  
-------------------------
TRNBLC1   26.5   382    1         0.2039                  0.2313                  4.4044         0.7293        0.0989   0.1460   0.0198   12.6653         
TRNBLC2   26.5   382    2         0.2946                  0.2609                  3.6880         0.6445        0.1023   0.1276   0.0146   10.1004         
TRNBLC3   26.5   382    3         0.1983                  0.2211                  3.6594         0.7692        0.1053   0.1623   0.0290   14.9696         
TRNBLC4   26.5   382    4         0.3287                  0.3292                  4.8574         0.5423        0.1194   0.1438   0.0239   13.5438         
TRNBLC5   26.5   382    5         0.2542                  0.2721                  2.1266         0.6072        0.1094   0.1391   0.0242   11.8293         
TRNBLC6   26.5   382    6         0.1821                  0.1386                  0.9240         0.1871        0.1131   0.1247   0.0296   10.4901         
TRBLLC1   29.0   382    1         0.3767                  0.2511                  4.4633         0.6055        0.0979   0.1472   0.0245   9.2501          
TRBLLC2   29.0   382    2         0.2577                  0.2577                  5.2033         0.7539        0.1548   0.1300   0.0260   7.6332          
TRBLLC3   29.0   382    3         0.3963                  0.3049                  4.2684         0.6214        0.1319   0.1628   0.0294   11.6901         
TRBLLC4   29.0   382    4         0.2659                  -0.0441                 6.2187         1.3215        0.0748   0.0990   0.0127   8.5805          
TRBLLC5   29.0   382    5         0.3542                  0.2827                  5.2673         0.8818        0.0603   0.1289   0.0291   11.1460         
TRBLLC6   29.0   382    6         0.1090                  0.1122                  2.3970         0.3777        0.1186   0.0102   0.0022   9.8907          
TRNBMC1   26.5   607    1         0.2853                  -0.5289                 2.5664         0.6633        0.1148   0.0903   0.0113   8.5938          
TRNBMC2   26.5   607    2         0.2338                  0.3269                  2.1566         0.4465        0.1281   0.0984   0.0186   11.9185         
TRNBMC3   26.5   607    3         0.1074                  0.1771                  2.3575         0.4677        0.0935   0.1311   0.0273   12.8183         
TRNBMC4   26.5   607    4         0.2316                  0.2968                  0.7547         0.2805        0.1538   0.1062   0.0183   10.6208         
TRNBMC5   26.5   607    5         0.3615                  0.4189                  1.5672         0.5083        0.0947   0.1232   0.0219   9.2000          
TRNBMC6   26.5   607    6         0.0703                  0.0978                  1.2278         0.3048        0.1084   0.0797   0.0176   12.9324         
TRBLMC1   29.0   607    1         0.2748                  0.2698                  1.7796         0.3465        0.0984   0.1380   0.0231   12.7971         
TRBLMC2   29.0   607    2         0.2423                  0.1607                  1.6907         0.3312        0.1027   0.1589   0.0256   14.5675         
TRBLMC3   29.0   607    3         0.3275                  0.3882                  6.7408         1.0325        0.1017   0.0840   0.0153   16.1401         
TRBLMC4   29.0   607    4         0.3025                  0.2974                  3.2236         0.6001        0.1203   0.1373   0.0252   9.8677          
TRBLMC5   29.0   607    5         0.2633                  0.3076                  3.0542         0.6177        0.0936   0.1270   0.0243   10.7532         
TRBLMC6   29.0   607    6         0.0660                  0.1175                  2.3352         0.4881        0.1148   0.0834   0.0165   7.9507          
TRNBHC1   26.5   741    1         0.1902                  0.2161                  4.3232         0.7495        0.0973   0.1024   0.0163   9.3993          
TRNBHC2   26.5   741    2         0.3091                  0.2705                  4.4100         1.0529        0.1143   0.1026   0.0143   9.4072          
TRNBHC3   26.5   741    3         0.3789                  0.2747                  4.6777         0.9529        0.0940   0.1209   0.0164   12.0778         
TRNBHC4   26.5   741    4         0.2862                  0.2078                  2.0351         0.3317        0.1152   0.1210   0.0220   15.5896         
TRNBHC5   26.5   741    5         0.3400                  0.2443                  3.0033         0.7638        0.0812   0.1625   0.0289   8.7500          
TRNBHC6   26.5   741    6         0.0917                  0.0607                  2.7895         0.5645        0.1284   0.0930   0.0177   6.9183          
TRBLHC1   29.0   741    1         0.2564                  0.0787                  5.6508         0.6000        0.0810   0.1431   0.0210   11.4948         
TRBLHC2   29.0   741    2         0.2208                  0.1560                  3.1666         0.5059        0.1042   0.1697   0.0303   12.3266         
TRBLHC3   29.0   741    3         0.3386                  0.2642                  1.7518         0.2989        0.1040   0.1322   0.0252   15.0079         
TRBLHC4   29.0   741    4         0.2125                  0.1649                  2.9042         0.4018        0.0930   0.1266   0.0222   10.9300         
TRBLHC5   29.0   741    5         0.2713                  0.1817                  2.2299         0.3474        0.1241   0.1293   0.0274   8.3818          
TRBLHC6   29.0   741    6         0.1066                  0.0714                  1.7178         0.2624        0.0940   0.1371   0.0328   7.2824